Okulumuz Kanuni Sultan Süleyman İlköğretim Okulu  olarak imar planında okul yeri olarak ayrılan arsanın 13/06/1986 yılında Kadıköy İlçesi'ne bedelsiz hibe edilerek 1988 yılında ilkokul ihalesi ile yapımının tamamlanmasıyla 1989-1990 eğitim - öğretim yılından itibaren merkezi sistemle öğrenci kaydına başlamıştır. Okulumuza bu adın verilmesinde genç yaşta Osmanlı tahtına çıkan ve Osmanlı İmparatorluğu´ na en parlak dönemini yaşatan Kanuni Sultan Süleyman ´ ın bilime ve sanata değer veren kişiliğinin büyük etkisi vardır.

Kanuni Sultan Süleyman İlköğretim Okulu Kadıköy İlçe Belediyesi´ ne bağlı olan İçerenköy Mahallesi'nde Kaynak Sokak´ ta ilkokul ve ortaokul olarak eğitim ve öğretime açılmıştır. Okulun ilk müdürü Muhittin BİLGİ´ dir.

2008 yılında Ataşehir İlçesi kurulunca, İçerenköy Mahallesi Ataşehir İlçesine bağlanmıştır.

Okulumuzun tapusu 15/12/1999 yılında alınmıştır. 750 metrekare bahçe alanına sahip okul arsası 568/3115 payı Kadıköy Belediyesi adına kayıtlı olup, Kadıköy Belediyesi´ nin 21/09/1995 tarih ve 1598 sayılı yazısının ekli 14/08/1995 tarih ve 154/6 encümen kararında bu payın 222 sayılı ilköğretim ve eğitim yasasının 62. ve ek 2. maddesi gereğince bedelsiz olarak İl  Özel İdaresi'ne devri yapılmıştır. Daha sonra bahçe genişletme çalışmaları yapılarak bahçe şu anki genişliğine ulaşmıştır.

2010 Haziran ayında İl Özel İdaresi'nin güçlendirme ve onarım çalışmaları nedeniyle ilçemiz Yahya Kemal Beyatlı Ortaokulu´ na misafir olan okulumuz, 2011 yılı Ocak ayında kendi binasina taşınmıştır.

2012- 2013 eğitim- öğretim yılı itibariyle 4+4+4 kademeli eğitim planının hayata geçmesiyle okulumuzun ilkokula dönüşümü gerçekleşmiştir. Okulumuz 2013-2014 eğitim öğretim yılından itibaren ilkokul olarak değerli öğrenci ve velilerimize hizmet vermektedir.

Öğretim yılı kronolojisine göre okulumuzda görev yapan müdürlerimiz aşağıdaki gibidir:

1990-1998 yıllarında Muhittin BİLGİ, okulumuzun ilk müdürü olarak görev yapmıştır.

1998 yılında Cemal ORAL okul müdürlüğüne vekalet etmiştir.

1998-2000 öğretim yıllarında Sevgi KUMRU vekaleten okul müdürlüğü görevini yürütmüştür.

2000-2010 yıllarında Bahçeli KOÇ okul müdürlüğü görevini yürütmüştür.

2010-2014 yıllarında Vahdeddin ULUGÖL okul müdürü olarak görev yapmıştır.

2014-2016 yılları arasında  Yakup YILMAZ okul müdürü olarak görev yapmıştır.

2016-2017 eğitim öğretim yılında Murat DEMİR okul müdür vekili olarak görev yapmıştır.

2017-2018 eğitim öğretim yılından itibaren okul müdürü olarak Oğuz CİNOĞLU görev yapmaktadır.